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蛋白质定向改造ProteinMPNN
蛋白质改造-ProteinMPNN
发布日期：2024-12-20
发布者： 合肥科晶生物
ProteinMPNN 是一款专为蛋白质序列设计开发的深度学习模型，旨在根据给定的蛋白质结构生成高质量的氨基酸序列。它在蛋白质工程与定向进化领域表现出色，为设计具有特定功能的新型蛋白质提供了强大的工具支持。
传统的蛋白质定向进化需要通过反复突变和筛选优化蛋白功能，耗时且效率较低。而ProteinMPNN 能够通过深度学习快速生成与目标结构高度匹配的序列，显著加速蛋白质定向设计的过程。该模型通过分析蛋白质的结构特征，预测并优化残基排列，从而设计出稳定且功能符合要求的蛋白质序列。
ProteinMPNN 在蛋白质功能优化、结合亲和力增强和稳定性改进等方面表现出色，适用于酶工程、抗体设计、合成生物学等多个领域。通过与实验定向进化结合，ProteinMPNN 提供了更加高效、精准的蛋白质设计方案，推动了蛋白质工程技术的发展。
图1：原始蛋白经过ProteinMPNN改造后，蛋白质序列发生较大改变，蛋白构象差异较小（RMSD=1.779）。